Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK8P49336 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms