Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms