Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APOBEC1P41238 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms