Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRMP28827 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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