Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms