Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms