Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DMDP11532 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DMDP11532 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DMDP11532 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DMDP11532 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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