Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM58BPP0C7Q3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms