Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4BP0C0L5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms