Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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