Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms