Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HELTA6NFD8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms