Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms