Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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CALCOCO1Q9P1Z2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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