Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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