Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXQ1Q9C009 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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