Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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