Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms