Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms