Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms