Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms