Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms