Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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