Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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