Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms