Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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