Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms