Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSC2P49815 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSC2P49815 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSC2P49815 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSC2P49815 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSC2P49815 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSC2P49815 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms