Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPB2P35606 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms