Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRMP28827 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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