Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTSSP25774 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTSSP25774 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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