Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRCP23327 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRCP23327 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HRCP23327 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HRCP23327 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRCP23327 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HRCP23327 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRCP23327 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRCP23327 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRCP23327 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRCP23327 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms