Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms