Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2B1P20020 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms