Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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