Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms