Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms