Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VTNP04004 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VTNP04004 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VTNP04004 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VTNP04004 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms