Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCAP01258 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCAP01258 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCAP01258 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCAP01258 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms