Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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