Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DENRO43583 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DENRO43583 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DENRO43583 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DENRO43583 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DENRO43583 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DENRO43583 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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