Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRD1A4D1F6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRD1A4D1F6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRD1A4D1F6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRD1A4D1F6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms