Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJB4Q9UDY4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJB4Q9UDY4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DNAJB4Q9UDY4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms