Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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