Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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