Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms