Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms