Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PLD3Q8IV08 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLD3Q8IV08 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PLD3Q8IV08 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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