Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC84Q86UT8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms