Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRAPPC6BQ86SZ2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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